回到南京，程慈航(喬振宇 飾)一次次想用真誠(chéng)打動(dòng)歐陽(yáng)倩(安以軒 飾)，歐陽(yáng)倩看到程慈航糾纏不休，違心地說(shuō)方捷確實(shí)是自己男朋友。這個(gè)結(jié)果可以解釋歐陽(yáng)倩的反常，但這個(gè)最壞的結(jié)果讓程慈航陷入絕望。

錦線還沒(méi)來(lái)得及把假五九檔案這個(gè)燙手山芋扔給哈金斯，中田派出的特工就盯上了齊掌柜的健康藥店。從外面回來(lái)的李麗蘭(王偉 飾)和齊掌柜發(fā)現(xiàn)有人在健康藥店設(shè)伏之后，李麗蘭為了保護(hù)更多的錦線弟子不受傷害，堅(jiān)持要拿回錦線的秘密文件。經(jīng)過(guò)一番激烈的搏斗，李麗蘭和齊掌柜殺死敵人，匆忙中的李麗蘭害怕文件有所遺漏，一把火燒了健康藥店。

絕望的程慈航只好用查找五九檔案來(lái)麻醉自己，他找莫采石(巫剛 飾)詢問(wèn)五九檔案的消息。莫采石以長(zhǎng)者的姿態(tài)勸程慈航，歐陽(yáng)倩不值得他繼續(xù)愛(ài)下去，霍蜜兒(郭曉婷 飾)才是他最合適的伴侶。這時(shí)，嚴(yán)達(dá)慶(王品一 飾)來(lái)報(bào)告錦線堂口發(fā)生兇殺案。程慈航?jīng)Q定利用首席大偵探的權(quán)力，把錦線弟子全部逮捕，以此達(dá)到保護(hù)錦線的目的。程慈航周身彌漫出來(lái)的煞氣，讓本已心情平靜的莫采石心神惶恐不已。

李麗蘭發(fā)現(xiàn)連警方都對(duì)錦線下手，她讓齊掌柜離開南京找馬太太告知情況，自己要找哈金斯，把這個(gè)燙手山芋扔給美國(guó)人。李麗蘭以五九檔案會(huì)給錦線帶來(lái)禍端為由要把五九檔案交給哈金斯，哈金斯以為撿了個(gè)大便宜，他答應(yīng)李麗蘭，自己會(huì)向中國(guó)政府發(fā)外交照會(huì)針對(duì)錦線問(wèn)題提出抗議。哈金斯剛從中央儲(chǔ)備銀行取出鐵匣子，就遭到不明身份人的襲擊。程慈航認(rèn)為歹徒一定是為五九檔案而來(lái)，他要立即找哈金斯問(wèn)個(gè)清楚。國(guó)際飯店，上當(dāng)受騙的哈金斯在程慈航面前假裝糊涂，他告訴程慈航，襲擊自己的應(yīng)該是錦線弟子，督促程慈航對(duì)錦線展開抓捕。哈金斯漏洞百出的話讓程慈航不知道是否應(yīng)該對(duì)付馬太太。

話說(shuō)包子店老板看到報(bào)紙上大肆報(bào)道五九檔案的消息，這才想起老乞丐交給自己的鐵匣子，他翻箱倒柜找到之后，和報(bào)紙上的圖片一比較，確認(rèn)就是在江湖上引起血雨腥風(fēng)的五九檔案，包子店老板欣喜萬(wàn)分。五九檔案重現(xiàn)江湖，齊掌柜準(zhǔn)備告訴馬太太這一消息，籌錢購(gòu)買。行色匆匆的齊掌柜遭到警察的追捕，歐陽(yáng)倩及時(shí)把她救下，安排齊掌柜走相對(duì)安全的水路。

程慈航仔細(xì)回憶歐陽(yáng)倩在處理錦線問(wèn)題上的種種可疑之處，他決定趕往江流灣探明真相。

江流灣，宮本在戚玉芳的精心照料下，已經(jīng)痊愈。不明就里的戚玉芳誤以為這個(gè)姓楊的真是軍官，面對(duì)宮本的甜言蜜語(yǔ)，戚玉芳邀請(qǐng)宮本陪自己到江北逛廟會(huì)。

江湖上的騷動(dòng)引起南京城的混亂，霍然(屈剛 飾)告訴莫采石，蔣委員長(zhǎng)對(duì)此非常生氣，警察廳難辭其咎。關(guān)于五九檔案的消息眾多，一時(shí)真假難辨，莫采石趕忙進(jìn)入臥室查看自己放在保險(xiǎn)柜里的五九檔案。

歐陽(yáng)倩看到程慈航一身殺氣直奔江流灣而去，她要不惜一切代價(jià)阻止程慈航抓到馬太太，她趕到江邊把馬太太從半路截了下來(lái)。馬太太決定從陸路進(jìn)入戚家莊和戚成祖匯合。戚成祖親自到碼頭迎接馬太太，他看到程慈航領(lǐng)著一干警察對(duì)旅客進(jìn)行搜查。程慈航發(fā)現(xiàn)戚成祖形跡可疑，讓手下上前盤問(wèn)。戚成祖謊稱自己是江東村的王勇，對(duì)江東村情況很熟悉的警察讓戚成祖到警察廳證明身份，錦線弟子劉三掩護(hù)戚成祖逃跑時(shí)被抓。這時(shí)，歐陽(yáng)倩和關(guān)天平趕來(lái)支援程慈航，程慈航讓歐陽(yáng)倩幫助自己查找錦線的秘密基地，他告訴歐陽(yáng)倩，要把錦線所有成員抓捕歸案。不明白程慈航良苦用心的歐陽(yáng)倩譴責(zé)他忘恩負(fù)義，程慈航只好把自己真實(shí)的目的告訴歐陽(yáng)倩。

得到五九檔案贗品的哈金斯被江湖人士騷擾得沒(méi)有辦法，他要求莫采石代表中國(guó)政府官方召開新聞發(fā)布會(huì)澄清真相。