闖王大軍入城。曹化淳開彰義門，帶領(lǐng)三百多名太監(jiān)恭迎闖王。袁承志(竇智孔 飾)安排各路人馬接應(yīng)闖王。天下大事初定。袁承志自己只身再次入宮刺殺崇禎(高虎 飾)，不想宮內(nèi)遍尋崇禎與阿九(孫菲菲 飾)不獲。抓住個(gè)下太監(jiān)一問，原來崇禎竟然逃出宮去了，袁承志急忙去追。崇禎換上普通人衣帽，帶著一些持兵器的武閹在四城亂撞，卻無法找到一條求生之路，于是遣散宦官，自己只身又回到了宮中，他再次敲響了景陽宮的大鐘，卻沒有一個(gè)官員前來報(bào)到。

袁承志沒有找到崇禎，惦念阿九，又回到宮中。此時(shí)的崇禎已經(jīng)瘋狂，周皇后上吊，崇禎連連叫好，隨即又親手砍殺了幾個(gè)嬪妃，而趕來的女兒阿九不愿離開宮時(shí)，崇禎猜到阿九是在等袁承志，崇禎騙過金蛇劍，一劍砍斷了阿九的左臂。袁承志于此時(shí)趕到，救下阿九，他出手要?dú)⒊绲?，崇禎閉目待死，阿九大叫了一聲“不要!”但是袁承志卻在此時(shí)理解了崇禎的悲哀心境，因?yàn)檫@個(gè)人已經(jīng)死了，他做了十七年的皇帝，卻沒有過過一天快樂的日子。

崇禎此時(shí)但求一死，他告訴袁承志，自己殺袁崇煥的時(shí)候只有十九歲，比袁承志現(xiàn)在還小，他要做中興之主，卻成了亡國(guó)之君，自己沒有面目去見列祖列宗，袁承志卻說，也許你的列祖列宗沒臉見你。于是，袁承志放過崇禎，他抱了阿九，走出宮去。此時(shí)四野寂寂，袁承志心中百感交集，望著懷中的斷臂的阿九，只想大哭一場(chǎng)!崇禎與太監(jiān)王承恩自縊于煤山……回到正條子胡同。此時(shí)的山宗舊部看到斷臂的阿九，聯(lián)想到她國(guó)破家亡的身世，不免對(duì)阿九有了難得的寬容。但是青青看到袁承志抱回阿九，反應(yīng)十分強(qiáng)烈……因?yàn)樵兄静坏珱]有殺崇禎，且還將阿九帶了回來!雖說阿九身世堪憐，得到了大家的同情，青青不得不忍下心中不快，但袁承志忙于大事，也忽略了對(duì)青青的關(guān)心。闖王登基，封袁承志為三品果毅將軍。論功行賞。封崇禎太子為宋王。

與此同時(shí)，袁承志和李巖兩人在北京街頭見到許多百姓遭到闖軍的劫掠，許多是劉宗敏的部下，但是這些人仗著劉宗敏的權(quán)勢(shì)，根本不把二人放在眼里，袁承志勃然大怒，出手懲戒，這才讓這些人有所收斂，只是人數(shù)太多，讓李巖、袁承志二人抓不勝抓，只能是浩然長(zhǎng)嘆。不但闖王的軍隊(duì)并不是想象中的王者之師，等真正見到權(quán)將軍劉宗敏時(shí)更是生了大麻煩，劉宗敏先不滿足于只分到了幾名宮女，而袁承志卻擁有了美麗的阿九公主，加之袁承志懲治了他的部下，更是惱火，于是非要搶奪阿九。他本以為只要一聲令下，袁承志小小的果毅將軍還不馬上獻(xiàn)上公主，不想袁承志根本不買賬。劉宗敏惱羞成怒，于是派兵去搶。袁承志雖然人馬少，但是個(gè)個(gè)武功高強(qiáng)，劉宗敏無法得逞，雙方僵持不下。

最終經(jīng)過李巖的努力，還是闖王出面，才暫時(shí)平息了二人的爭(zhēng)斗。山宗舊部如孫仲壽等人懇請(qǐng)闖王，此時(shí)還不是慶功的時(shí)候，關(guān)外的滿清仍在虎視眈眈，不可掉以輕心，但此時(shí)的闖王已經(jīng)過度膨脹，完全聽不進(jìn)去，反而將眾人斥退。孫仲壽連連嘆息…其實(shí)這是上梁不正下梁歪，李巖和袁承志就曾聽說闖王自己搶了吳三桂的愛妾陳圓圓，劉宗敏有此舉也不奇怪。阿九之事雖然平息，但是袁承志的后院卻起火了，青青認(rèn)為袁承志此舉完全是為了阿九與劉宗敏爭(zhēng)風(fēng)吃醋甚至是大打出手，和袁承志大吵了一架。

而此時(shí)的袁承志，已經(jīng)悲哀地發(fā)現(xiàn)闖軍變質(zhì)了，其軍紀(jì)似乎比明軍好不到哪里……心情郁悶之下，反而斥責(zé)了青青在國(guó)家劇變的時(shí)候居然還為這等兒女情長(zhǎng)的小事煩他，青青從來沒見過袁承志這樣疾言厲色地對(duì)待自己，更認(rèn)為袁承志是為阿九才如此，大哭而去……但是袁承志已經(jīng)無法去安撫青青了，他和李巖跑到皇宮門前求見闖王，希望闖王能夠整肅軍紀(jì)。但是闖王卻在元龍高臥，根本不見。袁承志和李巖在宮外足足等了一夜，最終還是無奈而返。難道改朝換代之后換來的就是這些嗎?兩人在巷子口遇到了一個(gè)唱曲的盲人，他唱的曲子竟一直在袁承志心頭回蕩——昨日的萬里長(zhǎng)城，今日的一縷英魂…